היעילות של המינוקסידיל קשורה לחומרת ההתקרחות והיא מותנית בנוכחות שערות בקרקפת. המינוקסידיל אפקטיבי כל זמן שמשתמשים בו - ברגע שמפסיקים ימשך תהליך ההתקרחות. השימוש בתכשיר מלווה לעיתים בגירוי הקרקפת אולם רק כ-6% מן המשתמשים סובלים ממנה. יש למרוח אותו פעמיים ביום ישירות על הקרקפת במינון של מיליליטר אחד ולעסות כדי שיספג.